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“怀特博士，我们还是别继续寻找神奇宝贝超古代文明了，我们都找了四个月了，除了发现一些遗物外没什么结果，既然那个文明已经灭绝，那他就没什么值得我们借鉴的，所以找这个文明毫无意义。”傍晚时分，一个矮胖的戴眼镜的中年人站在帐篷外手里捏着张照片，对着帐篷里整理物品的漂亮少女这般说道，而照片上是他的老婆和女儿，很明显，中年人思乡了所以想回家。
那少女长得十分漂亮，清秀的面容，大大的眼睛，洁白的皮肤，即使穿着工作服也无损她的美丽，她停下摆弄手中的物品，转过头说道：“我知道大家都想家，不过寻找这个文明注定是我一生的羁绊，而我有种直觉这次定会有结果，所以请团长您和大家再宽限我两个星期，两个星期后要是没结果我就和你们一起回去。”
大叔看见少女这么说，想了想回答道：“好吧，两个星期我们还等得起，我先去忙了。”
这段对话被旁边树上的一只姆克儿看在眼里，这只姆克儿听完这句话立刻腾空而起，飞向远方。
这只姆克儿飞了一会，最后停到了它的主人～一位紫发少女的肩膀上，紫发少女和姆克儿交流了一阵后，对着自己身后的一位黑发双马尾少女笑着说道：“欣，你果然猜的没错，那些科考队员再过两个星期就会离开。”黑发少女听完后笑了，她的后面明显是一个古代的祭坛，祭坛上放着一口古朴的大钟。
当然这两名少女就是李欣和夏美，她们在紫苑镇修整了一天后，李欣认为夏美的飞行系精灵只有热带龙还不够，而且热带龙几乎只当飞机用实在可怜，当然飞机的工作也不可缺少，所以得有轮班的精灵，她和夏美商议后，最终决定二人决定要只姆克儿，于是李欣带夏美飞到尼比市，夏美自己抓了一只姆克儿。
接着两人飞到常磐市进入22号路，不过两人不是去参加冠军赛，而是要去寻找超古代文明，李欣知道那里藏着可能毁灭神奇宝贝世界的命运，他和夏美商量后两人决定必须将其消灭，否则等于留着一颗不定时炸弹。
李欣凭借着球球的指引很快找到了祭坛，找到了封印胡地的金色之角，和封印大胖丁的钟，不过地下的封印耿鬼的黑石她可不敢动，因为那些石头要是离开土壤耿鬼就出来了。
而且李欣为了防止怀特为首的科考队员靠近坏事，所以她和夏美用草系能力让附近的树快速生长，形成天然迷宫让人无法靠进祭坛，而且她们还派出精灵监视科考队员们，刚才就是姆克儿回来报告打听到的消息。…
不过李欣对于那三只精灵为什么会发生那么大的变异一无所知，只能把它们放出来取它们的血样化验寻找原因，不过那胡地和耿鬼一出来就决斗是万万不能放出来的。为了找到原因李欣只能从安全的变异大胖丁下手，反正变异大胖丁只是会唱让所有人睡着的歌曲而已，基本是无害的，而且大胖丁出来的条件是唱歌绝招，李欣为此特地带来了会这招的七夕青鸟。
不过谁能听了变异大胖丁的歌曲不睡觉呢？夏美的怨影娃娃这家伙是不眠特性，所以不会睡觉，李欣把一个大注射器给它，教会了它怎么做。接着李欣命令自己的七夕青鸟唱歌引大胖丁出来。七夕青鸟照办，大胖丁出来了，不过它出来看见没人就想回去，这时候怨影娃娃立刻扎了它的屁股抽血，不过它刚抽完血想走就被大胖丁抓住了。
李欣和夏美大惊失色，刚迈步想去救它，不过大胖丁抓住怨影娃娃就唱起歌来，歌声的魔力实在太强，两人没怎么抵抗就睡着了，就连李欣这个神兽也没多撑一会。
等两人醒过来，却发现大胖丁竟然躺在地上，嘴上挂着幸福的微笑，但是它的呼吸心跳都停止已经死了。而且奇怪的是胖丁身上的黑色条纹也淡了很多，怨影娃娃呆立在一旁，手中依然拿着装满血的注射器，身体不停的颤抖着。李欣和夏美大吃一惊，立刻问道：“这大胖丁怎么死了？”
怨影娃娃回答：“虽然我被它抓着很害怕，但是后来它只顾唱歌所以我慢慢就平静下来了，我听它的唱歌觉得很好听就开始鼓掌喝彩，它听见我鼓掌喝彩也就越唱越起劲，后来它唱完了，把我放在地上，冲我鞠了一躬就自己躺下死了。”
李欣听完怨影娃娃的陈述，眉头皱起一言不发接过注射器，立刻把血取出稍微加工后，开始用显微镜观察大胖丁的血细胞。夏美则指挥精灵挖个大坑把大胖丁埋起来。
良久李欣抬起头表情严肃的说道：“我弄明白了，这些精灵中了某种未知微生物，这种未知微生物与宿主是共生关系，它们会使宿主身上长出花纹，更能使宿主拥有了强大的力量，而且这种微生物会指示宿主用强大的力量互相战斗以打开时空之门，然后很有可能它们主人的大部队就会过来侵略这里，这种微生物应该是某个外星种族的侵略工具。不过你们放心，这微生物无法再空气中生存，所以不会传染。”
大家听到李欣的话脸色大变，夏美却提出一个问题，：“感染这种微生物的精灵有三只，那么为什么只有耿鬼和胡地互相战斗，胖丁却没有呢？”
李欣摇头回答：“这种微生物只能扩展宿主的**，胡地和耿鬼原来就是宿敌，所以都以“打倒对方”为目标，战斗**十分充足，战斗**被扩大后自然会互相战斗，而大胖丁的目标是“找到能听完我一首歌的听众”微生物只能扩大这个**，所以它根本没有战斗的**，自然不会战斗。这也就是大胖丁找到听众后立刻就死了的原因，因为微生物的寄生，它只剩下了“找到能听完我一首歌的听众”一种**，这**满足后就再没有活下去的动力了，只能去死了。”
李欣说完这段话后心情沉重，这沉重即是为大胖丁的死，也是大胖丁死后再也没有可以制服耿鬼和胡地的力量。
李欣很快就想通了现在她只能自己将这件事办好。李欣看了自己和夏美手上的精灵，她的六种精灵是鬼斯通，炒勺勇吉拉，死神棺，末入蛾，豪力，七夕青鸟。而夏美的精灵是姆克儿，椰蛋树，水箭龟，烈焰猴，铜镜怪，长鼻叶。
李欣叫鬼斯通去布置陷阱，夏美和其他精灵负责帮忙。而她自己则想办法杀死这些微生物。
陷阱布置有条不紊的进行着，炒勺勇吉拉突然问鬼斯通：“这陷阱对于鬼系的精灵没用吧，也就是困不住耿鬼的。”
鬼斯通笑道：“这我知道，但是它肯定能困住胡地，而且不止困住这只大胡地，还能困住小胡地。”
炒勺勇吉拉听完后气得胡子一跳，咬牙回答：“我的勺子也能打趴下大耿鬼，更能打趴下小耿鬼。”于是两个家伙互看了一眼，互相做个鬼脸哈哈一笑后继续工作。
等陷阱布置的差不多了，李欣终于找到了办法，这微生物控制宿主生成一种奇异能量，而这种能量即可增强宿主的力量也是微生物的食物，自己只要用驱散全部中和这种能量，等这能量没了，微生物自然就死了。
李欣知道了对手的弱点，立刻开始制定作战计划，……
李欣对大家说了自己的计划后，就让大家准备好后藏起来，而她自己变成速度形态，然后启动延时机关把勺子插进黄金之角里放出了大胡地，大胡地放出后立刻使出石化功，地上立刻出现了不少岩石，李欣赞叹这家伙要是去工地绝对受欢迎，连找土填地基都不用了，不过大胡地耀武扬威了一阵，立刻被椰蛋树的催眠粉，七夕青鸟的唱歌和铜镜怪的催眠术击中昏昏欲睡。
李欣切换成体重最重的防御形态从天上掉下来正好砸在大胡地头上，大胡地被压得倒在地上，李欣随后用四只熊爪使出试刀让大胡地无法起身，同时发动驱散中和大胡地体内的奇异能量，接着大家一拥而上对着大胡地各自使出绝招痛打落水狗。在战斗中由于李欣开着光环且这时候大家都进了全力，李欣的豪力发出白光进化成怪力，鬼斯通发出白光进化成耿鬼，炒勺勇吉拉发出白光进化成炒勺胡地，夏美的姆克儿进化成姆克鸟。大胡地最后被李欣中和了奇异能量，微生物因此死亡，失去了微生物立刻变弱，最后在大伙的虐待下含恨而终。
下面大家挖出黑石头放出大耿鬼，结果大耿鬼看见大胡地死了，自己很快也也倒地死亡，神奇宝贝世界的隐患就此解除了。
不过两人还在祭坛的周围挖出了大批神奇宝贝和人的尸骨，而很多都是自杀的，李欣想起了这出土的可达鸭的雕像上也有花纹，知道了原因，这是因为那种微生物只能放大生物某种十分强烈的**，而大部分精灵是没有十分强烈的**的，所以即使被感染它们也没事，只是它们知道真相后为了不成为毁灭世界的帮凶选择了自杀。而精灵死了，主人也不想独活，于是也自杀了。
李欣和夏美将尸骨重新埋好，那大胡地和大耿鬼的尸体也被她们挖坑埋了。然后对着那祭坛鞠了几个躬，解开了树林迷宫，告诉了怀特的探险队祭坛的所在，当然那里还有文物，就是没“炸弹”了。然后它们回到了常磐市想要休息，不过她们不知道在常磐市里面有人想抓她们。